Au IXème ou Xème siècle :
II existait une petite église bordée à l'est d'un cimetière.
On a retrouvé une trentaine de tombes de pierre, dont celle de l'abbé avec son bâton pastoral en forme de tau.
Au Xème siècle : Jean réédifie une église dédiée à Notre Dame avec une chapelle à saint Jean-Baptiste, et cède ses biens à l’abbaye de Cluny, avant de devenir évêque de Sisteron en 964.
939 : Bulle du pape Etienne VIII qui confirme à l’abbaye de Cluny ses biens et dépendances, parmi lesquels Ganagobie.
Au XIIème siècle : L'église est agrandie à ses dimensions actuelles.
Le monastère qui ne compte pas plus de 13 moines, connaît rayonnement et prospérité pendant deux siècles.